胃肠外科专业始建于1980年，设编床10张。1996年成为独立科室。现在有病床32张，教授8人，副教授4人，主治医师4人，副主任护师、主管护师及专业护理人员共30余人。其中博士生导师一人，硕士生导师6人，培养博士研究生5人、硕士研究生20余人，在读博士研究生10人。胃肠外科年门诊量8万余人次，住院患者3.5万余人次。
拥有电子胃镜、结肠镜，洗肠机，激光治疗仪、冷冻治疗仪等上百万元的大型医疗仪器。护理设备有心电监护仪、中心吸引和中心吸氧、电动防压疮气垫、静脉输液泵、鼻饲泵、空气洁净台、静脉留置针及PICC、造口及伤口护理用品等。
1、低位直肠癌管状吻合器吻合手术，套迭式结肠会阴再造肛门及拉出式结肠肛管吻合术，经腹骶直肠癌根治术，提高了直肠癌患者的生活质量。开展了直肠全系膜切除超低位吻合直肠癌根治术，降低了局部复发率。应用直肠疾病新理论，新观念开展了吻合器行齿线上直肠粘膜环行切除肛垫上移手术（PPH）治疗Ⅱ-III°内痔，最大限度的解除病人疼痛，缩短病人住院时间。利用股薄肌，掌长肌腱移植治疗肛门失禁获得成
